Instalaciones

Microbiología (MICRO)

Responsable:

Dr. Pedro Antonio Jiménez Gómez (se.uec@mogmigp)

Oferta:

Detección por cultivo y recuento.

• Enterobacterias y recuento total a 37º.
• Coliformes-Escherichia coli y Salmonella sp.
• Enterococos feales y recuento total.
• Esporulados aerobios.
• Clostridios sulfito reductores.
• Staphylococous auerus y Listeria monocitogenes.
• Control in situ de residuos orgánicos.
• Hongos y levaduras y recuento total a 22º.
• Mesófilos totales a 37ºC.
• Otros microorganismos a consultar.

•  Detección por ELISA – Sistema VIDAS® ((Especialmente interesante para los siguientes sectores: Sector de producción anima; Sector hostelero; Sector industrial; Sector farmacéutico; Sector sanitario; Sector medioambiental…):

• Salmonella sp.

Validado AOAC RIdetección en todas las muestras ambientales recogidas en la planta de procesado.
Validado AFNOR detección en todas las muestras ambientales tomadas en planta de producción.

• E. coli O157.
• Listeria sp : en el medio ambiente de producción.

Validado AOAC RIdetección en todas las muestras ambientales recogidas en la planta de procesado.
Validado AFNOR detección en todas las muestras ambientales tomadas en la planta de producción:

• Campylobacter.

• Identificación por cultivo:

Cultivo en galería semiautomática:

• Bacilos Gram negativos:

103 taxones (Enterobacterias, Vibrionaceae, Pseudomonadaceae y otras no-enterobacterias). Resultados: 18-24 h después de crecimiento fresco en placa.

• Cocos Gram positivos:

61 taxones de estreptococos y géneros afines (Enterococcus, Aerocaccus, Erysipelothrix, Gardnerella, Gemella, Lactococcus, Abiotrophia, Affoiococcus, Leuconostoc, Listeria). Resultados: 24 h después de crecimiento fresco en placa.
35 taxones de estafilococos y géneros afines (Aerococcus, Micrococcus, Stamatococcus, Kocuria, Dermacoccus). Resultados: 24 h después de crecimiento fresco en placa.

• Bacterias anaerobias:

80 taxones (Bacilos y cocos Gram positivos y negativos).

• Levaduras:

62 taxones. La base de datos para las levaduras más amplia de todos los sistemas comercializados.

• Identificación mediante PCR-secuenciación:

Existe la posibilidad de identificar cualquier microorganismo del dominio eubacteria cuya secuencia se encuentre depositada en NCBI - Gene-Bank

• Antibiogramas y antifungigramas:

Según técnicas de referencia de CLSI/NCCLS (estándar americano) y EUROCAST (estándar europeo).
Antibiogramas

• Bacilos Gram negativos:

Muestras urinarias. 17 antibióticos. Otro tipo muestras. 22 antibióticos.
Antibiograma rápido. 15 antibióticos.
Antibiograma rápido enterobacterias. 30 antibióticos.
Pseudomonas y otros BGN no-fermentadores. 17 antibióticos.
Bacterias de origen veterinario. 28 antibióticos. 18-24 h.

• Cocos Gram positivos:

Para estreptococos y neumococos. Test de susceptibilidad mediante determinación de CMI
Para enterococos. 14 antibióticos.                                       
Para estafilococos. 17 antibióticos.

Anaerobios: Bacterias anaerobias estrictas. 13 antibióticos.24-48 h. Test de susceptibilidad mediante determinación de CMI
Haemophilus y Branhamella: 13 antibióticos. 18-24/48 h

Antifungigramas
Determinación de la sensibilidad a los 5 agentes antifúngicos principales para Candida spp. y Criptococcus neoformans.

•  Instrumentación y equipamiento: 
• Laboratorio de microbiología.
•  Instrumentación:

• Preparación de medios de cultivo:

Agitadores magnéticos. AGIMATIC-Selecta®

• Esterilidad:

Autoclaves. AUTESTER-Selecta®

• Seguridad biológica:

Cabina de seguridad biológica tipo III. Faster® BH-EN 2004.

• Cultivo microbiano:

Estufas. Selecta®

• Identificación, antibiograma y antifungigrama por cultivo: Sistema ATB plus

ATB-EXPRESSION. VITEK Systems©. Procesado a través de ordenador IBM® con software “atb-plus” ©.

• Densitómetro:

Densimat©

• Identificación por ELISA: Sistema VIDAS©

MiniVIDAS©.

• Pipetas: Gilson®
• Centrífugas:

Mikro 24-48R. Hettich®

• Identificación por PCR:

Termociclador MJ mini BioRad®
Fuentes de electroforesis Power PAC 300 BioRad®
Cubetas de electroforesis: Sub-Cell GT©.

• Sistemas de lectura de geles (Biología molecular):

GEL-DOC BioRad® 2007

• Epidemiología molecular:

Sistema para PFGE (Pulsed Fiels Gel Electrophoresis):
Chef-DR II System BioRad®
Chef-DR III System BioRad®

• Microscopios:

Nikon-optiphot®

• Captación y análisis de imágenes microscópicas

Software